Steht doch alles in der Anleitung?
Du kopierst die Version 1.0.6 in den Ordner old
kopierst Version 1.0.7 in den Ordner new
Die Datei index.php suchst alle Dateien mit "prosilver", kopierst die und änderst "prosilver" in Prosilver_SE (oder wie immer du den Style genannt hast).
Wie du im Template-Ordner im Vergleich zu Prosilver sehen kannst sind da wesentlich weniger html-Dateien drinnen. Die nicht vorhandenen musst du nat. aus den neu erstellten Zeilen entfernen, da sonst der Updater meldet:
"Update-Paket unvollständig"
Schau dir einfach den Code in Ruhe an dann wirst du sehen daß eben alle Dateien von Prosilver kopiert wurden - bis auf die nicht vorhandenen Dateien.
Ist komplizierter als es ist - ich hab zum Kopieren, Unbennenen und raussuchen der vorhandenen Dateien 3 Minuten gebraucht
PS:
Sollte ich den Style beim nächsten Update noch haben kann ich dir die Datei wieder zur Verfügung stellen - einfach melden