
die 3er-versionen haben den 'vorteil' das sie die UNION syntax noch nicht unterstützen und von daher gegen viele der aktuellen exploits gefeit sind - dafür wurden in der 4er-serie andere bugs behoben.
generell dürftest du aber mit der aktuellen empfehlung bei mysql.com auf die 'stable' 4.0.21 nicht unbedingt falsch liegen - in verbindung mit einem aktuellen phpBB2 (2.0.10) sollte das ganze 'relativ' gut sein. für die sicherheit relevant ist natürlich neben eventuell installierten mods/hacks auch die sonstige serverumgebung - d.h. ein aktueller apache (2.0.52) und ggfs. noch tools ala modsecurity... (und natürlich die schon o.a. empfehlung keine trivial-passwörter für ftp/mysql/server zugriff zu verwenden)